Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms