Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTR1Q8N1G2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms