Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms