Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF2Q8IX21 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms