Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms