Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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