Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NME9Q86XW9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms