Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TRAPPC6BQ86SZ2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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