Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT27Q7Z3Y8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT27Q7Z3Y8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms