Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms