Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LARP1Q6PKG0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LARP1Q6PKG0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms