Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM88Q6PEY1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms