Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
CSAG1Q6PB30 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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CSAG1Q6PB30 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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