Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF40BQ6NWY9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms