Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms