Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms