Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD40Q6AI12 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms