Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms