Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USPL1Q5W0Q7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms