Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM29Q5VYK3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms