Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP188Q5SRE5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP188Q5SRE5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms