Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COLEC12Q5KU26 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms