Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF2Q5BJF6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms