Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms