Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ESCO2Q56NI9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms