Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms