Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSD17B12Q53GQ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms