Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms