Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP28Q4G0W2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms