Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEACAM16Q2WEN9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms