Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC96Q2M329 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms