Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDB1Q16531 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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