Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms