Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC6Q16204 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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