Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRIP13Q15645 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIP13Q15645 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms