Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SF1Q15637 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SF1Q15637 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SF1Q15637 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SF1Q15637 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SF1Q15637 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SF1Q15637 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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