Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TAF11Q15544 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TAF11Q15544 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TAF11Q15544 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms