Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTF1Q15361 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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