Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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