Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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