Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD1Q15011 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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