Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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