Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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