Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RUNX3Q13761 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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