Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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