Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLD1Q13393 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD1Q13393 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms