Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF6Q13247 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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