Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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