Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACACAQ13085 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms