Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms